Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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NAE1Q13564 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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