| NAE1 | Q13564 | TLE6-202 | ENST00000452088 | 1883 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | KL-201 | ENST00000380099 | 5006 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | S100A16-204 | ENST00000368706 | 1118 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | C1QC-202 | ENST00000374639 | 1183 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | GAR1-202 | ENST00000394631 | 1011 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | C22orf39-203 | ENST00000399568 | 1005 nt | TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC097532.1-201 | ENST00000440802 | 322 nt | TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNCA-209 | ENST00000506244 | 570 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC02123-201 | ENST00000514869 | 885 nt | TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CFL1-202 | ENST00000524553 | 860 nt | TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SPCS2-202 | ENST00000526361 | 772 nt | TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | IGLL5-201 | ENST00000526893 | 1050 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | IGLL5-202 | ENST00000531372 | 882 nt | TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | KIRREL3-AS1-201 | ENST00000548204 | 586 nt | TSL 3 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL137786.1-202 | ENST00000555496 | 789 nt | TSL 5 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNHG15-206 | ENST00000580528 | 1073 nt | TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | MGRN1-201 | ENST00000262370 | 3968 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | NRXN1-204 | ENST00000401669 | 5870 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | ACAT2-201 | ENST00000367048 | 3180 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | ADAM6-201 | ENST00000606026 | 1843 nt | TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SLC25A22-201 | ENST00000320230 | 2796 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | HPGD-213 | ENST00000541923 | 2920 nt | TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | KLF10-202 | ENST00000395884 | 3659 nt | TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SHOX-201 | ENST00000334060 | 1951 nt | TSL 5 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | NFATC4-218 | ENST00000554966 | 2506 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | NFATC4-225 | ENST00000556169 | 2509 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | ATXN7-213 | ENST00000538065 | 6842 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | C17orf100-201 | ENST00000542475 | 1756 nt | APPRIS P1 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | BHLHE41-201 | ENST00000242728 | 3837 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | COL23A1-202 | ENST00000407622 | 2329 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | WDR45-206 | ENST00000376368 | 1381 nt | TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | OSGIN1-203 | ENST00000393306 | 1940 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | PARP9-204 | ENST00000471785 | 3040 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP000787.1-201 | ENST00000501356 | 1926 nt | TSL 2 BASIC | 16 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | FLAD1-203 | ENST00000315144 | 1730 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CLPTM1L-209 | ENST00000507807 | 1740 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | UNC5D-203 | ENST00000416672 | 3532 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRIM9-202 | ENST00000338969 | 3312 nt | TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | TMEM101-201 | ENST00000206380 | 1536 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | LCMT2-202 | ENST00000567039 | 1545 nt | TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | LYPD5-203 | ENST00000594013 | 1519 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CABP1-204 | ENST00000453000 | 1857 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CXXC1-201 | ENST00000285106 | 2936 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | RBPMS-203 | ENST00000339877 | 1341 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | BTBD3-201 | ENST00000254977 | 4686 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | FGFR2-207 | ENST00000359354 | 1680 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | PHF23-202 | ENST00000454255 | 1662 nt | TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SFRP2-201 | ENST00000274063 | 2032 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CTSB-201 | ENST00000345125 | 2028 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | PITPNA-201 | ENST00000313486 | 3912 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SSH3-201 | ENST00000308127 | 2871 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | RUSC1-201 | ENST00000292254 | 2163 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | TMEM51-202 | ENST00000376014 | 1843 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | WNT10B-203 | ENST00000407467 | 1802 nt | TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC098591.1-201 | ENST00000381811 | 1613 nt | TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SPACA4-201 | ENST00000321762 | 972 nt | APPRIS P1 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | PAXX-201 | ENST00000371620 | 812 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CTRC-202 | ENST00000375949 | 898 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | AMACR-204 | ENST00000382085 | 1195 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | MSRB1-202 | ENST00000399753 | 847 nt | TSL 3 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | PRR29-203 | ENST00000425164 | 1266 nt | TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CSAD-208 | ENST00000444623 | 2122 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | PMF1-BGLAP-203 | ENST00000490491 | 1007 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | HOXC-AS3-202 | ENST00000513165 | 533 nt | TSL 3 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC019257.1-202 | ENST00000521498 | 445 nt | TSL 5 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | DYNLL1-204 | ENST00000548214 | 616 nt | TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | BRF1-219 | ENST00000551787 | 824 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | IGFLR1-205 | ENST00000588992 | 730 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CROCCP3-203 | ENST00000589964 | 255 nt | TSL 3 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | C18orf21-207 | ENST00000610527 | 1059 nt | TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | IRF1-211 | ENST00000613424 | 821 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | C18orf21-208 | ENST00000618334 | 856 nt | TSL 3 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC091812.2-201 | ENST00000619081 | 385 nt | BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP005329.2-201 | ENST00000580139 | 1771 nt | TSL 2 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRABD-202 | ENST00000380909 | 2272 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | BSCL2-210 | ENST00000421906 | 1440 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CCDC90B-203 | ENST00000525503 | 1919 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | MAP2K7-202 | ENST00000397981 | 3430 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | LEF1-201 | ENST00000265165 | 3068 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | GSKIP-205 | ENST00000555181 | 2218 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZNF805-201 | ENST00000354309 | 2396 nt | TSL 5 BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | WDR20-211 | ENST00000556807 | 2382 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | ST3GAL6-214 | ENST00000483910 | 1886 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CIAPIN1-209 | ENST00000567518 | 2016 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.99 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | BIN3-201 | ENST00000276416 | 1835 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | ARHGAP39-202 | ENST00000377307 | 4673 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | QRICH1-201 | ENST00000357496 | 3083 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SSH1-201 | ENST00000326470 | 2432 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | KLC2-203 | ENST00000394066 | 2591 nt | TSL 2 BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC092143.3-201 | ENST00000565150 | 1900 nt | TSL 5 BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | BAP1-202 | ENST00000460680 | 3937 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | ACSF3-204 | ENST00000406948 | 2247 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | ACE-202 | ENST00000290866 | 4959 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | SLC19A2-202 | ENST00000367804 | 2976 nt | TSL 1 (best) BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | MLEC-201 | ENST00000228506 | 6626 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | RAB40B-206 | ENST00000571995 | 3859 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | MCM4-201 | ENST00000262105 | 4183 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | CGREF1-201 | ENST00000260595 | 1177 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | NIM1K-201 | ENST00000326035 | 2313 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |
| NAE1 | Q13564 | WASH6P-202 | ENST00000359512 | 1437 nt | BASIC | 15.98 | ■□□□□ 0.15 | | |