Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPM6BQ13491 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GPM6BQ13491 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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