Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TOP3AQ13472 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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