Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC005154.1-201ENST00000434399 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC034187.1-201ENST00000437047 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MKRN4PQ13434 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC093835.1-201ENST00000508072 568 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MKRN4PQ13434 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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