Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCOF1Q13428 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCOF1Q13428 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
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