Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLAMF1Q13291 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms