Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NME3Q13232 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NME3Q13232 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms