Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
STRN3Q13033 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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