Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRDM2Q13029 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRDM2Q13029 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
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