Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC10A2Q12908 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms