Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP7AQ04656 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP7AQ04656 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms