Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCN7AQ01118 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCN7AQ01118 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms