Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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H3F3AP84243 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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H3F3AP84243 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H3F3AP84243 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H3F3AP84243 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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H3F3AP84243 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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