Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN2P57739 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms