Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP7P55210 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP7P55210 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CASP7P55210 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CASP7P55210 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CASP7P55210 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CASP7P55210 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP7P55210 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP7P55210 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP7P55210 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP7P55210 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CASP7P55210 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms