Protein–RNA interactions for Protein: P55036

PSMD4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD4P55036 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMD4P55036 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMD4P55036 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms