Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GABRA4P48169 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GABRA4P48169 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms