Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCCP43146 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCCP43146 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCCP43146 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCCP43146 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DCCP43146 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms