Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCKBRP32239 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCKBRP32239 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms