Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCND2P30279 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCND2P30279 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCND2P30279 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCND2P30279 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms