Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPRMP28827 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms