Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHMP24386 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHMP24386 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms