Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XPAP23025 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XPAP23025 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
XPAP23025 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XPAP23025 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XPAP23025 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
XPAP23025 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
XPAP23025 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XPAP23025 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XPAP23025 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XPAP23025 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XPAP23025 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XPAP23025 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XPAP23025 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
XPAP23025 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
XPAP23025 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
XPAP23025 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
XPAP23025 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms