Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms