Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH1P12830 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDH1P12830 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms