Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LAMC1P11047 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMC1P11047 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms