Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Length 860 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LDLRP01130 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LDLRP01130 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LDLRP01130 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LDLRP01130 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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