Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR1AO95602 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
POLR1AO95602 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms