Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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PRAMEF10O60809 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF10O60809 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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