Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYTIPO60759 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms