Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARHGEF9O43307 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms