Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
UBDO15205 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBDO15205 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBDO15205 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBDO15205 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBDO15205 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBDO15205 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBDO15205 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBDO15205 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBDO15205 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBDO15205 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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