Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBXN8O00124 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms