Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NEDD8-MDP1E9PL57 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms