Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NPIPB13A6NJU9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms