Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PARP3Q9Y6F1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PARP3Q9Y6F1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PARP3Q9Y6F1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PARP3Q9Y6F1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms