Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP20Q9Y6A4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP20Q9Y6A4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP20Q9Y6A4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP20Q9Y6A4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms