Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUBP2Q9Y5Y2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NUBP2Q9Y5Y2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NUBP2Q9Y5Y2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NUBP2Q9Y5Y2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms