Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TSSC4Q9Y5U2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TSSC4Q9Y5U2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSC4Q9Y5U2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSC4Q9Y5U2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSC4Q9Y5U2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSC4Q9Y5U2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSC4Q9Y5U2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSC4Q9Y5U2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSC4Q9Y5U2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TSSC4Q9Y5U2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TSSC4Q9Y5U2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms