Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB2Q9Y5E7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB2Q9Y5E7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCDHB2Q9Y5E7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDHB2Q9Y5E7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms