Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHB9Q9Y5E1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB9Q9Y5E1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB9Q9Y5E1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms