Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4S1Q9Y587 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4S1Q9Y587 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4S1Q9Y587 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms