Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
HECTD4Q9Y4D8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HECTD4Q9Y4D8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HECTD4Q9Y4D8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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