Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKP3Q9Y446 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKP3Q9Y446 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKP3Q9Y446 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms