Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y4

PYGO1, Pygopus homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO1Q9Y3Y4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO1Q9Y3Y4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PYGO1Q9Y3Y4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PYGO1Q9Y3Y4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PYGO1Q9Y3Y4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PYGO1Q9Y3Y4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PYGO1Q9Y3Y4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PYGO1Q9Y3Y4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PYGO1Q9Y3Y4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PYGO1Q9Y3Y4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PYGO1Q9Y3Y4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms