Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHTOPQ9Y3Y2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CHTOPQ9Y3Y2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CHTOPQ9Y3Y2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms