Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TPRKBQ9Y3C4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPRKBQ9Y3C4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TPRKBQ9Y3C4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms