Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
REXO2Q9Y3B8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
REXO2Q9Y3B8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
REXO2Q9Y3B8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms