Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EMC9Q9Y3B6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMC9Q9Y3B6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EMC9Q9Y3B6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms