Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLR1DQ9Y2S0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
POLR1DQ9Y2S0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms